健康管理师证书是由多个国家和地区的专业机构颁发的，包括中国、美国、澳大利亚等，健康管理师证书主要由以下几个部门颁发：

1、中国卫生健康委员会

中国卫生健康委员会(简称“国家卫健委”)是中华人民共和国国务院组成部门之一，负责全国卫生和健康事业的管理和监督，国家卫健委下属的职业卫生与健康教育研究中心负责健康管理师的培训、考试和证书颁发工作。

2、各省市卫生健康委员会

除了国家卫健委外，各省、市、自治区卫生健康委员会也有一定的职责和权力，负责本地区卫生和健康事业的管理，部分省市卫生健康委员会也会颁发健康管理师证书，但通常需要通过国家卫健委的认证。

3、行业协会和专业机构

还有一些行业协会和专业机构负责健康管理师的培训和认证工作，中国健康促进会、中国保健协会等，这些组织会对参加培训和考试的健康管理师进行评估，合格者可以获得相应的证书。

4、国际组织和外国政府机构

随着全球化的发展，越来越多的国际组织和外国政府机构开始关注中国的卫生和健康事业，一些国际组织如世界卫生组织(WHO)和联合国儿童基金会(UNICEF)等，也会与中国的相关机构合作，共同推动健康管理师培训和认证工作，一些国家如美国、澳大利亚等，也有自己的健康管理师证书体系，但在中国需要通过国家卫健委的认证。

健康管理师证书的颁发涉及多个部门和机构，包括国家卫生健康委员会、各省市卫生健康委员会、行业协会和专业机构以及国际组织和外国政府机构等，获得健康管理师证书需要通过国家卫健委的认证和评估，以确保证书的权威性和专业性，健康管理师也需要不断学习和提高自己的专业素养，以更好地服务于社会和公众的健康需求。