生殖健康管理师发证机构是由国家卫生健康委员会(简称国家卫健委)负责办理的，国家卫健委是中华人民共和国国务院组成部门，主要负责全国卫生健康工作的规划、监管和管理，生殖健康管理师作为专业的健康领域人才，其发证和认证工作自然由国家卫健委来负责。

生殖健康管理师是指在生殖健康领域具有专业知识和技能，能够为个人或家庭提供科学、合理的生殖健康咨询和服务的专业人员，生殖健康管理师的主要职责包括：开展生殖健康教育、评估、干预和指导；协助患者解决生殖健康问题；提供生殖健康政策、法规和技术信息等。

为了规范生殖健康管理师行业，保障人民群众的生殖健康权益，国家卫健委制定了相关政策法规和标准，根据这些政策法规和标准，国家卫健委设立了专门的生殖健康管理师职业技能鉴定考试机构，负责组织和管理生殖健康管理师的职业技能鉴定工作，通过职业技能鉴定考试，对参试人员的专业知识和技能进行全面、客观、公正的评价，确保生殖健康管理师具备相应的专业素质和能力。

在生殖健康管理师发证过程中，国家卫健委会对参试人员进行严格的资格审查，确保申请人符合颁发证书的基本条件，国家卫健委还会对参试人员的专业知识、技能和实际操作能力进行考核，确保生殖健康管理师具备较高的业务水平，只有在通过考试并获得相应资格证书的人员，才能获得生殖健康管理师的发证资格。

国家卫健委还会定期对生殖健康管理师行业进行监管和指导，确保行业健康发展，对于违反相关政策法规的行为，国家卫健委将依法进行查处，维护生殖健康管理师行业的正常秩序。

生殖健康管理师发证机构是由国家卫生健康委员会负责办理的，国家卫健委作为我国卫生健康事业的主管部门，始终致力于推动生殖健康管理师行业的规范化、专业化发展，为广大人民群众提供优质的生殖健康服务。