农艺师职称证丢失后，需要到相关部门进行补办，补办流程和所需材料可能因地区而异，但通常包括以下几个步骤：

1、报案：您需要向当地公安机关报案，说明农艺师职称证丢失的情况，公安机关会为您开具一份《丢失证件报案回执》。

2、准备材料：根据当地公安机关的要求，准备好相关证明材料，这些材料可能包括身份证、户口本、工作单位证明等，具体所需材料请咨询当地公安机关。

3、填写申请表：携带好所有材料，前往当地人力资源和社会保障局(或人才市场)领取《专业技术职称证书补发申请表》，认真填写申请表，并确保所填信息真实、准确。

4、提交申请：将填好的申请表和相关证明材料一起提交给当地人力资源和社会保障局(或人才市场)，他们会对您的申请进行审核。

5、等待审批：审核通过后，您需要支付一定的补办费用，补办费用因地区而异，一般在几十元至几百元之间，具体费用请咨询当地人力资源和社会保障局(或人才市场)。

6、领取新证：补办手续办理完毕后，您可以凭原证书的遗失声明和补办费用发票，到当地人力资源和社会保障局(或人才市场)领取新的农艺师职称证书。

需要注意的是，不同地区的补办流程和所需材料可能有所不同，建议您提前向当地人力资源和社会保障局(或人才市场)咨询具体事宜，为了避免类似情况再次发生，建议您妥善保管个人职称证书，如有遗失要及时报案并补办。