在填写心理咨询师资格证书发证机关时，需要根据实际情况选择相应的发证机关，心理咨询师资格证书的发放主要由以下几个部门负责：

1、中国心理卫生协会(CPA)

中国心理卫生协会(CPA)是由国家卫生健康委员会主管的全国性专业社会组织，成立于1953年，CPA的主要职责是制定和推广心理健康领域的行业标准、规范和政策，组织和开展心理健康领域的学术交流和合作，培养和选拔心理健康领域的专业人才，以及对心理健康领域的工作进行监督和管理。

2、各省、自治区、直辖市心理咨询师培训基地

各省、自治区、直辖市心理咨询师培训基地是由当地卫生健康委员会主管的培训机构，主要负责为心理咨询师提供专业的培训和考核，在完成培训课程并通过考核后，学员可以向当地的心理咨询师资格认定委员会申请颁发心理咨询师资格证书。

3、国务院各部门、直属机构和中央企业

国务院各部门、直属机构和中央企业等单位也会设立心理咨询室或心理援助中心，配备专业的心理咨询师，这些单位的心理咨询师可以在本单位内部为员工提供心理健康服务，同时也可以通过中国心理卫生协会(CPA)进行资格认证和继续教育。

4、其他社会组织和企事业单位

一些社会组织和企事业单位也会设立心理咨询室或心理援助中心，配备专业的心理咨询师，这些组织的心理咨询师同样可以通过中国心理卫生协会(CPA)进行资格认证和继续教育。

在填写心理咨询师资格证书发证机关时，需要根据自己的实际情况选择相应的发证机关，如果你是在某省、自治区、直辖市的心理咨询师培训基地完成培训并通过考核的，那么你应该选择该省、自治区、直辖市的心理咨询师资格认定委员会作为发证机关，如果你是在国务院各部门、直属机构或中央企业等单位工作的，那么你应该选择这些单位内部的心理咨询室或心理援助中心作为发证机关。

在填写心理咨询师资格证书发证机关时，要确保所填写的信息准确无误，以免影响后续的职业发展和资质认证，也要关注中国心理卫生协会(CPA)发布的相关政策和指南，及时了解心理咨询行业的最新动态和要求。