农艺师证书是由多个部门颁发的，包括农业部门、林业部门、畜牧业部门等，农业部门是最主要的颁发机构之一，农业部门是指中华人民共和国农业农村部，该部门负责制定和实施有关农业和农村发展的政策、法规和规划，以及对农艺师进行认证和管理。

除了农业部门外，其他颁发农艺师证书的部门还包括：

- 国家林业局(现为国家公园管理局):负责制定和实施有关林业发展的政策、法规和规划，以及对林艺师进行认证和管理。

- 国家畜牧局(现为农业农村部畜牧业司):负责制定和实施有关畜牧业发展的政策、法规和规划，以及对畜艺师进行认证和管理。

- 各省市自治区政府农业部门：在国家层面上，各省市自治区政府也会设立相应的农业部门，并负责本地区农业发展的管理和监督，这些地方性的农业部门也会对本地区的农艺师进行认证和管理。

需要注意的是，不同部门对于农艺师所需要掌握的知识和技能要求可能存在差异，在申请农艺师证书时，需要根据自己所在的行业和领域选择合适的颁发机构。