健康管理师是一个专业的健康领域职业，主要负责对个人或群体的健康状况进行评估、分析、指导和干预，以提高人们的健康水平，健康管理师的发证部门主要有以下几个：

1、国家卫生健康委员会(原卫生部)

国家卫生健康委员会是中华人民共和国国务院组成部门之一，负责全国卫生和健康工作的政策制定、法规制定、标准制定和组织实施，在健康管理师培训和考试方面，国家卫生健康委员会具有权威性和主导地位，通过国家卫生健康委员会认证的健康管理师证书具有较高的权威性和认可度。

2、中国保健协会

中国保健协会是一个全国性的非营利性社会组织，成立于1989年，其宗旨是推动保健事业的发展，提高人民群众的健康水平，中国保健协会负责组织和管理健康管理师的培训、考试和发证工作，通过中国保健协会认证的健康管理师证书在行业内具有一定的影响力。

3、各省级卫生健康委员会

各省、自治区、直辖市卫生健康委员会在地方范围内负责本行政区域内的卫生和健康工作，部分省份的卫生健康委员会也会组织和管理健康管理师的培训、考试和发证工作，通过省级卫生健康委员会认证的健康管理师证书在地方范围内具有一定的权威性。

4、用人单位要求

许多企事业单位、医疗机构等在招聘健康管理师时，会要求应聘者具有国家卫生健康委员会、中国保健协会或其他省级卫生健康委员会认证的健康管理师证书，具备这些部门发证的健康管理师在求职过程中具有一定的优势。

5、国际认证

随着全球化的发展，越来越多的人关注国际健康管理领域的发展，部分国家和地区会对健康管理师进行国际认证，如美国注册健康教练(Certified Health Coh)、加拿大注册营养顾问(Registered Nutrition Consultant)等，这些国际认证的健康管理师证书在国际范围内具有一定的认可度，有助于提升个人的职业竞争力。

健康管理师哪个部门发证有效主要取决于发证部门的权威性、认可度和行业需求，在选择健康管理师培训和考试时，建议优先考虑国家卫生健康委员会、中国保健协会等具有较高权威性的部门发证的证书，以提高个人的职业素质和竞争力，关注国际健康管理领域的发展，取得国际认证的健康管理师证书也是提升个人职业竞争力的重要途径。