中医康复理疗师证书发证机关是指负责对中医康复理疗师进行资格认证和发放证书的政府部门或机构，中医康复理疗师证书的发证机关主要有以下几个：

1、国家卫生健康委员会(原卫生部):作为国家级卫生健康部门，国家卫生健康委员会负责制定和发布中医药行业的政策法规，对中医康复理疗师的培训、考核和资质认证具有权威性，国家卫生健康委员会下设的中医药管理局负责具体实施中医康复理疗师的培训和考核工作。

2、各省、自治区、直辖市卫生健康委员会：各级卫生健康委员会在国家卫生健康委员会的指导下，负责本辖区内中医康复理疗师的培训、考核和资质认证工作，各地卫生健康委员会可以根据实际情况制定具体的培训和考核标准。

3、中医药行业协会：中医药行业协会是一个行业组织，负责组织和推动中医药行业的发展，一些中医药行业协会也会参与中医康复理疗师的培训和考核工作，但其发证权有限，主要是对培训质量和考核结果进行评价和推荐。

4、职业培训机构：为了满足市场需求，许多职业培训机构也开设了中医康复理疗师培训班，这些培训机构需要接受国家卫生健康委员会和各级卫生健康委员会的监管，确保培训质量，学员完成培训后，可以向相关部门申请中医康复理疗师证书。

5、企事业单位：一些企事业单位为了提高员工的专业素质和技能水平，会开展中医康复理疗师的培训和考核工作，这些单位需要向当地卫生健康委员会申请发证，学员完成培训和考核后，可以获得中医康复理疗师证书。

中医康复理疗师证书的发证机关主要包括国家卫生健康委员会、各省、自治区、直辖市卫生健康委员会、中医药行业协会、职业培训机构和企事业单位等，考生在报名参加中医康复理疗师培训和考试时，应选择具有权威性和良好口碑的发证机关进行报名，以确保所获得的证书具有法律效力和行业认可，考生还需关注相关政策和法规的变化，不断提高自己的专业素养和技能水平，为患者提供更优质的服务。